Bezoeker kunnen in het museum persoonlijk kennismaken met twee continue expositie en in de buitenruimte met kopieën van de fundering van acht kerken vorstenpaleizen van Mikulčice. De oudere continue expositie „Groot-Moravisch Mikulčice - Vorstenburcht in de dalbeemd van de rivier de Morava“ werd in 1997 geopend in het bezoekerscentrum (paviljoen I). Deze expositie presenteert Mikulčice als vermaarde Slowaakse en Groot-Moravische zetel met een rijke historie, waarvan archeologische vondsten getuigen.